Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6CQ53S08 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms