Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROX2Q3B8N5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms