Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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