Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RTN1Q16799 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RTN1Q16799 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RTN1Q16799 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RTN1Q16799 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RTN1Q16799 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RTN1Q16799 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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RTN1Q16799 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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RTN1Q16799 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RTN1Q16799 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
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RTN1Q16799 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RTN1Q16799 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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