Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NRF1Q16656 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NRF1Q16656 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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NRF1Q16656 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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NRF1Q16656 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRF1Q16656 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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