Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms