Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL1Q16048 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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