Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA2Q15822 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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