Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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NCOA1Q15788 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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NCOA1Q15788 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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NCOA1Q15788 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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NCOA1Q15788 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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NCOA1Q15788 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NCOA1Q15788 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
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