Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms