Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms