Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC3Q15034 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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