Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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