Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GAPVD1Q14C86 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
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