Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHPRHQ149N8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHPRHQ149N8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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