Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1D2Q14995 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NR1D2Q14995 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms