Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms