Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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