Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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