Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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