Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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