Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAMK2BQ13554 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms