Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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TUBB3Q13509 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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