Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTGDRQ13258 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms