Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF2Q12933 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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