Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms