Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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