Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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