Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms