Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms