Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms