Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms