Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms