Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FPGSQ05932 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FPGSQ05932 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms