Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms