Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms