Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2BQ02880 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms