Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms