Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIM1P81133 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIM1P81133 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIM1P81133 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIM1P81133 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIM1P81133 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIM1P81133 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIM1P81133 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIM1P81133 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIM1P81133 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIM1P81133 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms