Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS23P62266 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS23P62266 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms