Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms