Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UFM1P61960 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UFM1P61960 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UFM1P61960 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms