Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TMEM258P61165 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TMEM258P61165 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TMEM258P61165 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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