Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME5P56597 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms