Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP3P54852 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms