Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms