Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms