Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX2P50458 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX2P50458 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX2P50458 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX2P50458 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX2P50458 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX2P50458 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms