Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD2P49005 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLD2P49005 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLD2P49005 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD2P49005 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD2P49005 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD2P49005 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD2P49005 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD2P49005 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD2P49005 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD2P49005 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD2P49005 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD2P49005 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD2P49005 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD2P49005 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD2P49005 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD2P49005 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD2P49005 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD2P49005 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms