Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms